iTunes Connect にログインして、「Binary Details」ページの「Reject Binary」ボタンをクリックすると、ステータスが「Developer Rejected」に変更されて、バイナリが審査待機リストから削除されます。

参考情報

・iPhoneアプリ申請やAppleの審査に関するメモ - Qiita [キータ]