Atom にインストールしてる atom-ternjs パッケージが Failed to find plugin node-express というエラーになったときの解決方法をご紹介します。
解決方法は Third party plugins - atom-ternjs に書いてますが、
$ cd ~/.atom/packages/atom-ternjs
$ npm install tern-node-express
すれば、サードパーティー製プラグイン tern-node-express がインストールされます。
初回インストール時でなければ、atom-ternjs のアップデートかなにかの影響で tern-node-express プラグインがインストールされてなかっただけなので、適宜インストールしましょう。