MongoDB の ISODate から年月日の部分だけ文字列を取得するには、toISOString() と substring() を使って以下のようなコードで取得できます。

now = ISODate()
// ISODate("2016-12-06T05:02:20.675Z")

now.toISOString().substring(0, 10)
// 2016-12-06

年月日だけ使いたいことがあったので自分用のメモとして記事に残しておきます。

• String.prototype.substring() - JavaScript | MDN
• String.prototype.slice() - JavaScript | MDN

substring() じゃなくても slice() でもよいです。その辺はお好みでどうぞ。