Eclipse のプロジェクトを切り替えのときに Java + Tomcat の設定を変更する箇所をご紹介します。

・[ウィンドウ] → [設定] 　　・[Java] → [インストール済みのJRE] → （該当するJREを選択）

　　・[Tomcat] 　　　　・[Tomcatバージョン] を該当のものに設定 　　　　・[Tomcatホーム] にてホームを指定する 　　　　（例）C:Usersyour_usernameDocumentsdevelopmentpleiades-e3.7-ultimate-jretomcat6.0 とか 　　　　・[JVM設定] → [JRE] を該当のものに設定する

・Project上で右クリック → [プロパティ] 　　・[Javaコンパイラー] 　　　　・[プロジェクト固有の設定を可能にする]にチェックする

以上です。